材料定義の細目名称で選択ウィンドウになければ、名称マスターに戻って登録し直さないといけないのでしょうか。

細目名称は自由に入力することが可能です。
選択ウィンドウに無い場合は、類似の項目を選択し細目名称欄で直接編集してください。
計算書・明細書には直接編集した項目名称で集計されます。